Les méthodes DFT dopent la conception de nouvelles enzymes

Comment les méthodes de calcul DFT* et la diffusion de neutrons aux petits angles peuvent-elles être combinées pour créer de nouvelles enzymes ? C’est le sujet d’un article publié par une équipe internationale comprenant des chercheurs d’IRIG et de l’ILL. Il rappelle en particulier que la DFT, utilisée au départ pour des systèmes de quelques dizaines d’atomes, atteint voire dépasse aujourd’hui les 100 000 atomes. Ceci grâce à une approche qui calcule la structure électronique du système à partir de celle de blocs plus petits (ex. : chacun des acides aminés d’une protéine).

La taille mémoire requise et le temps d’exécution restent ainsi très raisonnables. IRIG, qui a publié quatre articles sur les méthodes DFT par ondelettes cette année, collabore sur ce sujet avec des chercheurs de Boston et de Kobé (Japon).

Contact : luigi.genovese@cea.fr

* théorie de la fonctionnelle de la densité

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